تولّى سعادة الشيخ محمد بن حمد آل ثاني منصب نائب محافظ ونائب رئيس مجلس إدارة مصرف قطر المركزي منذ مارس 2018، وعُيّن الشيخ محمد نائباً لرئيس مجلس إدارة هيئة التنظيم في أبريل 2018، وأيضاً رئيساً لمجلس إدارة هيئة قطر للأسواق المالية ونائباً لرئيس مجلس إدارة بنك قطر للتنمية في خلال العام 2018- 2019.

وقد شغل قبل ذلك العديد من الأدوار الإدارية العليا حيث تولّى سابقاً منصب مدير إدارة المخاطر بمصرف قطر المركزي حتى عام 2012. كما شغل منصب سكرتير الممثل الشخصي لسموّ الأمير لشؤون المتابعة لمدّة خمس سنوات.